新方法推動(dòng)了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)的發(fā)展
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法使科學(xué)家能夠一對(duì)一地研究成千上萬(wàn)來(lái)自活生物體的單個(gè)細(xì)胞，并對(duì)每個(gè)細(xì)胞的遺傳物質(zhì)進(jìn)行測(cè)序。在每種細(xì)胞類型中，基因的激活方式不同，從而產(chǎn)生了神經(jīng)元，皮膚細(xì)胞和肌肉細(xì)胞等細(xì)胞類型。
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)使科學(xué)家能夠鑒定出每種細(xì)胞類型中活躍的基因，并發(fā)現(xiàn)這些遺傳差異如何改變細(xì)胞的身份和功能。仔細(xì)研究這些數(shù)據(jù)可以發(fā)現(xiàn)新的細(xì)胞類型，包括以前未觀察到的干細(xì)胞，并幫助科學(xué)家追蹤復(fù)雜的發(fā)育過(guò)程。
“單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)已經(jīng)**改變了生物學(xué)，但仍處于活躍發(fā)展的領(lǐng)域，”博士學(xué)位的Helena Garcia Castro解釋說(shuō)。牛津布魯克斯大學(xué)生物與醫(yī)學(xué)系的學(xué)生，也是該論文的科普中國(guó)靠譜嗎合著者。
“目前的方法是將細(xì)胞解離方案與'活'組織一起使用，這會(huì)使細(xì)胞承受壓力，導(dǎo)致細(xì)胞發(fā)生改變，并限制了精確的研究?！?/p>
為了解決這個(gè)問(wèn)題，研究小組使用了歷史研究方法，并重溫了19世紀(jì)和20世紀(jì)的過(guò)程，創(chuàng)建了ACME(乙酸甲醇乙醇解離)方法。
科學(xué)家們意識(shí)到，使用這種方法，細(xì)胞不會(huì)停止解離，因?yàn)樗鼜难芯块_(kāi)始就停止了其生物活性并“固定”了它們。
然后，ACME方法允許在整個(gè)過(guò)程中將細(xì)胞冷凍保存一次或數(shù)次，無(wú)論是在解離過(guò)程之后，在現(xiàn)場(chǎng)還是在進(jìn)行多步操作方案時(shí)，都將其冷凍保存。
牛津布魯克斯大學(xué)研究學(xué)者Jordi Solana博士補(bǔ)充說(shuō)：“這意味著科學(xué)家現(xiàn)在可以在實(shí)驗(yàn)室之間交換樣品，保存細(xì)胞材料，并且可以冷凍大量樣品以進(jìn)行同時(shí)分析，而不會(huì)破壞遺傳材料的完整性。在牢房里。
“我們從舊論文中采用了該方法，并對(duì)其進(jìn)行了重新設(shè)計(jì)，使其能夠與當(dāng)前的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)一起使用。借助我們的新方法，我們現(xiàn)在著手表征許多動(dòng)物的細(xì)胞類型。”
現(xiàn)在，借助ACME方法，科學(xué)家們能夠與其他實(shí)驗(yàn)室合作，研究更廣泛的動(dòng)物細(xì)胞。如果沒(méi)有分離和冷凍活細(xì)胞組織的技術(shù)，這將是不可能的。
論文“ ACME解離：一種用于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)的通用細(xì)胞固定-解離方法”發(fā)表于Genome Biology。
標(biāo)簽： 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)
